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摘要组织病理学评估是诊断结直肠癌不可或缺的。然而，在显微镜下对患病组织的人工评估不能可靠地告知患者预后或对治疗选择至关重要的基因组变异。为了应对这些挑战，我们开发了多组学多队列评估(MOMA)平台，这是一种可解释的机器学习方法，用于系统地识别和解释三个大型患者队列(n= 1888).MOMA成功地预测了总生存率、无病生存率(对数秩检验P-值< 0.05)，以及CRC患者的拷贝数改变。此外，我... 摘要以单细胞分辨率描绘肿瘤为理解头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移的复杂性提供了机会。癌细胞轨迹的单细胞RNAseq (scRNAseq)分析确定了转移前细胞的亚群，由包括AXL和AURK在内的可操作途径驱动。阻断这两种蛋白可以减弱患者来源培养物中的肿瘤侵袭。此外，肿瘤浸润性CD8 + T淋巴细胞的scRNAseq分析显示了T细胞功能障碍的两种不同轨迹，基于单细胞T细胞受体测序的克隆结构证实了这一点... 摘要识别肿瘤细胞特异性标记物并阐明它们的表观遗传调控和空间异质性提供了对癌症病因学的机械见解。在这里，我们分别在34和28例人类透明细胞肾细胞癌(ccRCC)标本中进行了snRNA-seq和snATAC-seq，并与大量蛋白基因组学数据相匹配。通过多组学分层方法鉴定20种肿瘤特异性标志物，我们揭示了高铜蓝蛋白(大脑性麻痹)表达和降低的存活率。大脑性麻痹敲除，结合空间转录组学，提示CP在ccR... 摘要错义突变影响TP53通过灭活肿瘤抑制和赋予前致癌活性来促进致癌作用。我们在此报告了p53 DNA结合域(DBD)和反式激活域(TAD)错义突变体通过不同的、以前未被认识的分子机制出人意料地激活了前致癌表皮生长因子受体(EGFR)信号。特定于DBD和TADTP53突变体表现出不同的细胞定位和诱导不同的基因表达谱。在多种组织中，EGFR分别由胞质和核区室中的TAD和DBD突变体稳定。TAD突... 摘要尽管螫刺活化剂在早期临床试验中表现出有限的功效，但多种证据表明肿瘤细胞固有的螫刺功能在介导抗肿瘤免疫反应中的重要性。虽然人类黑色素瘤中的STING信号受损，但通过表观遗传重编程的恢复可以增加其抗原性和T细胞识别。在这项研究中，我们发现使用临床上可用的DNA甲基化抑制剂逆转鼠黑色素瘤细胞系中STING的甲基化沉默可以改善激动剂诱导的STING活化和I型IFN诱导，这在荷瘤小鼠中可以通过CD... 摘要尽管肿瘤微环境对胶质母细胞瘤(GBM)的深度免疫抑制的贡献是清楚的，但是调节对CD8 T细胞介导的杀伤的抗性的肿瘤细胞内在机制却不太清楚。激酶是潜在的药物靶点，可驱动肿瘤进展，并可能影响免疫反应。在这里，我们进行了一项体内CRISPR筛选，以确定导致肿瘤细胞逃避CD8 T细胞识别的神经胶质瘤内源性激酶。屏幕显示检查点激酶2 (Chek2)成为有助于逃避CD8 T细胞识别的最重要的激酶。目... 摘要人表皮生长因子受体2 (HER2)是一种受体酪氨酸激酶，在乳腺、胃和其他实体肿瘤中起致癌作用。然而，抗HER2疗法目前仅被批准用于治疗乳腺癌和胃/胃食管结合部癌，并且治疗耐药性仍然是个问题。在这里，我们设计了一种抗HER2 IgG1双特异性双抗体(Ab)，zanidatamab，与曲妥珠单抗和曲妥珠单抗加pertuzumab (tras + pert)的组合相比，具有独特和增强的功能。Z... 摘要雌激素受体(ER)阳性乳腺癌患者在原发性肿瘤切除和治疗后数十年内有转移性复发的风险，这是休眠的播散性肿瘤细胞(DTC)在继发性部位重新苏醒的结果。这里我们使用同基因ER+在小鼠模型中，DTC在年轻小鼠中表现出休眠表型，但在老化或纤维化微环境中加速转移生长。在幼鼠中，低水平PdgfcER的表达+二级站点的维护需要DTC，但不足以支持大规模数据库的开发。相比之下，血小板衍生生长因子(PDGF... 摘要在凋亡过程中，线粒体外膜通透化(MOMP)使某些线粒体基质大分子逃逸到胞质溶胶中。然而，线粒体RNA (mtRNA)在细胞凋亡过程中的命运是未知的。在这里，我们证明了MOMP导致mtRNA的胞质释放，而刽子手胱天蛋白酶-3和-7 (casp3/7)阻止胞质mtRNA触发炎症信号。在遗传或药理学casp3/7抑制的情况下，凋亡损伤导致MDA5/MAVS/IRF3途径的mtRNA激活，驱动I... 摘要丝氨酸合成对肿瘤生长和存活至关重要，但其在癌症中的调节机制仍不清楚。在这里，使用整合的代谢组学和转录组学分析，我们显示了代谢物和转录组之间的异质性。具体来说，肝细胞癌(HCC)组织中的丝氨酸水平增加，而丝氨酸生物合成途径中的第一个限速酶磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)的表达显著下调。有趣的是，由于蛋白质精氨酸甲基转移酶1 (PRMT1)介导的PHGDH在精氨酸236位的甲基化，通过增强的P... 免疫荧光方法中的重要环节1、冰冻切片制备：建议用新鲜组织，否则组织细胞内部结构破坏，易使抗原弥散。选用干净锋利的刀片、组织一定要冷冻适度等，防止裂片和脱片严重。2、组织切片固定：切好片风干后立即用冰丙酮等固定液进行固定5-10min，尤其要... 免疫组化成功的经验和失败的教训汇总1. 石蜡切片在染色过程中出现脱片现象？一般来说，如果用多聚赖氨酸包被过的片子做正常免疫组织化学染色的话是不会掉片子的。但如果要做抗原修复的话，如果片子处理不好的话是有可能掉片子的。你可以试试一下的方法：a... 免疫组化技术常见问题：1、石蜡切片和冰冻切片的比较？2、一抗和二抗的选择要点和技巧是什么？3、在什么情况下使用Triton-X100？4、封闭血清的选择原则是什么？5、抗体孵育条件的比较？6、一抗4度孵育后为什么要进行37度复温？7、DAB... 临床常用免疫组化指标的意义临床病理工作中，我们常用到“肿瘤细胞免疫组化耐药预后标记”，但是许多单位只写阳性结果，不写临床意义，其结果对临床帮助不大，因为许多医生不懂得这些结果的意义，因此建议大家在出此类报告时，把“肿瘤细胞免疫组化耐药预后标... 中国药典细菌内毒素检查法学习与讨论本法系利用从鲎的变形细胞中提取的试剂来检测或量化由革兰阴性菌产生的细菌内毒素，以判断供试品中细菌内毒素的含量是否符合规定的一种方法。细菌内毒素检查包括两种方法，即凝胶法和光度测定法，后者包括浊度法和显色基质... 细菌内毒素检查法研究进展细菌内毒素试验（简称“鲎试验）。自1973年以来，鲎试验被证明是一种有效检测细菌内毒素（热原）存在的试剂。于是1973年美国食品与药品管理署（FDA）就推荐鲎试验用于生产工艺流程的内毒素质量控制。因为这种鲎试验的灵敏... 免疫沉淀（IP）的常见问题及解答1. 用于一般免染的抗体是否都可以用作免疫沉淀实验？ 答：抗体的性质对免疫沉淀实验影响很大。抗体不同，和抗原以及Protein G或Protein A的结合能力也就不同。所以一般免染能结合的抗体未必能用于IP... |
