病毒、细胞和病毒感染
在MEM、Ham‘s F12、DMEM和RPMI 1640培养基中,分别添加10%热灭活胎牛血清(2mm),培养人肺泡上皮细胞(A 549)、293 T细胞和Jurkat细胞。L-谷氨酰胺、2毫米丙酮酸钠和1×PSF(青霉素、链霉素和漏斗酮),37℃,5%CO2...感染时,用磷酸缓冲液(Pbs)冲洗细胞,在指示的m.i处用PR8感染细胞。在含0.2%牛血清白蛋白(BSA)的PBS/BA中,1mm MgCl2,0.9毫米CaCl2青霉素、链霉素0.1mg/ml和青霉素100 U/ml,37°C下接种45 min,A 549或MDCK细胞分别在0.2%BSA和抗生素的培养基中孵育。用菌斑法测定细胞上清液中感染病毒的数量。40
矢量构造
利用具有以下限制性位点的引物构建了载体:
抗体、试剂和抑制剂
抗M1(SC-69824,SC-17589)和Cyt抗体c(SC-13560)是从圣克鲁斯生物技术(圣克鲁斯,加利福尼亚州,美国)。β-Actin(551527)、Apaf-1(611365)、caspase-8(551244)和bax(610983)特异性抗体来自BD生物科学(美国圣地亚哥)。Caspase-9(9501,9502),Caspase-7(9491,9491),Caspase-3(9662,9664),PARP(9541,9542),Bid(2002)和FLAG(DYKDDDDK,2368)的抗体来自于细胞信号技术公司(Danvers,MA,美国)。HSP 70抗体来源于美国上等州(Billerica,MA)(NBPI-49250)和BD生物科学(554243)。所有抗体均在1:1000稀释时使用,抗m1和抗-1除外。β-肌动蛋白,1:500使用。(西格玛,圣路易斯,美国;S 5921)在1。μ米/毫升,而马-心脏囊肿c(Sigma,C 7752)在10μ在1mm/ml时使用ATP(nb,p0756S)或dATP(N0440S),在80使用z-IETD-fmk(bd,550380)。μm/ml。
质粒和siRNA转染
293 T细胞、A 549细胞和Jurkat细胞均按制造商的指示转染Lipofectamine 2000(Invitrogen,Carlsbad,CA,USA)或SiPort-NeoFX(Ambion,奥斯汀,TX,USA)。自定义合成siRNA(5‘-CTCCATTGCCTGA-3’)M1来自Dharmacon(美国CO,Lafayette)。对照siRNA来自齐根(德国希尔登)(全星阴性对照,1027280)。
westernblot分析
用TOTEX缓冲液(pH7.9,0.35M NaCl,20%甘油,1%NP-40,1mMMgCl)提取总蛋白。2、0.5毫米EDTA、0.1毫米EGTA、50毫米NaF及0.3毫米Navo3含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂(Sigma)的混合物。免疫印迹用特异性抗体进行,用ECL Westernblotting检测试剂盒(米利波,Billerica,MA,美国)进行可视化。
细胞分馏
制备无细胞核和线粒体的胞浆提取物。简单地说,细胞用冰凉pbs(pH 7.2)洗涤,然后用低渗萃取缓冲液(HEb:50 mm管道pH 7.4,50 mm kCl,5 mm EGTA,2mm MgCl)洗涤。2、1mm二硫苏糖醇和0.1mm苯甲基磺酰氟(PMSF)离心。球团被重新悬浮在胚轴中,并在一台道斯均化器中溶解。该细胞裂解液在16000×离心条件下离心30 min。g在4℃下,立即检测澄清上清液,或将其保存在−80°C.用冰冷缓冲液A(250 mm蔗糖,20 mm HEPES,10 mm KCl,1.5mm MgCl)再悬浮细胞制备线粒体组分。21 mm EDTA,1mm EGTA,1mm DTT,17 mg/ml PMSF,8mg/ml抑肽酶,2mg/ml亮肽(pH7.4),在波特-托马斯匀浆器中进行匀浆。原子核以10分钟750的速度被球团化。g旋转。上清液为10000×g在A缓冲液中再悬浮25 min,在10000×离心条件下离心。g25分钟。将线粒体微丸重新悬浮,置于含7 M尿素、2 M硫脲、4%CHAPS、120 mm二硫苏糖醇(DTT)、2%两性电解质(pH 3-10)和40 mm Tris-HCl的缓冲液中30 min。
免疫共沉淀
用冰凉的PBS洗涤细胞,然后在含有10 mm Tris(pH8.0)、170 mm NaCl、0.5%NP-40和蛋白酶抑制剂的溶液中溶解30 min。用离心法去除细胞碎片,在4°C下用抗FLAG或M1或Apaf-1和抗Hsp 70抗体孵育,再用蛋白A-Sepharose孵育4h,用1 ml洗涤缓冲液(200 mm Tris,pH8.0,100 mm NaCl和0.5%NP-40)冲洗4次。用SDS样品缓冲液洗脱结合蛋白,用12%SDS-PAGE凝胶分别用抗Hsp 70和M1或Apaf-1抗体免疫印迹。
定量实时PCR
总RNA是根据制造商的指示用TRIzol(Invitrogen)提取的。用TRIzol法从4°C分离的细胞核和细胞质提取液中分离出细胞核和细胞质RNA。以1-2为原料制备cdna。μ用随机引物对RNA进行上标Ⅲ逆转录酶(Invitrogen)。采用SYBR Green(应用生物系统,福斯特市,美国)进行实时PCR反应(50°C 2 min,95°C 10 min,95°C 15 s,60°C 30 s,72°C 10 min)。可根据要求提供引物序列。
蛋白表达与纯化
蛋白在c41(DE3)株中的表达大肠杆菌细胞在37°C下培养至OD 600为1.0,然后用0.5或1.0mm异丙硫代氨基乙酸苷诱导,4h后进一步孵育,球状细胞在缓冲液A(8M尿素,0.1M NaH)中溶解。2阿宝40.01MTris-Cl,pH8.0)离心。用缓冲液A洗涤树脂,裂解上清液通过Ni-NTA自旋柱。用缓冲液B(8M尿素,0.1M NaH)洗涤Ni-NTA自旋柱。2阿宝4,0.01MTris-Cl,pH6.3,最后用洗脱缓冲液(8M尿素,0.1M NaH)洗脱结合蛋白。2阿宝4,0.01MTris-Cl,pH4.5)。洗脱后的蛋白经透析后被还原成天然构象。离体结合试验。透析缓冲液含尿素(8,6,4,2,1和0M),还原谷胱甘肽5 mm,氧化谷胱甘肽0.5 mm,甘氨酸50 mm,pH 9.0,EDTA 5 mm,甘油10%,葡萄糖10%,蔗糖10%,NaCl 250 mm,MgCl 2 mm。2,50 mm HEPES-KOH(pH7.5-7.9),0.5mm PMSF,2μg/ml抑肽酶和5μg/ml白蛋白胨。蛋白质在−80°C下保存,经肠激酶裂解(EK:底物比为1:42,温度为50 mm Tris,pH为7.6,加入1mm PMSF,95°C加热10 min,再通过Ni-NTA柱去除His标记)。
无细胞提取物的制备离体caspase活化
用离心法收集Jurkat细胞,用冰冷PBS洗涤两次.细胞颗粒在相同体积的HEB中再悬浮,在冰上孵育15 min,加入5%NP-40后,用10 s的强涡溶解。然后以15000×离心5分钟。g,胞浆上清液保存于−70°C,内源caspase-9分别加入1mmdATP/ATP和10 mMdATP/ATP激活。μ马心囊肿c(西格玛)至胞浆提取物(300)μG蛋白当量),在37℃下孵育。加入5×SDS负载缓冲液,煮沸5 min后,反应停止。不在场人士(50人)μ(G)用免疫印迹法检测caspase的处理情况。
caspase-9和caspase-3活性测定
来自对照细胞和m1 siRNA处理细胞的细胞裂解液感染r8,pdd-m1-转染的细胞或提取物离体caspase活化试验,按上述方法制备。用ApoAlert caspase荧光检测试剂盒(Clontech,山景城,CA,美国)分别用合成底物Lehd-AMC和DEVD-AFC测定实际Caspase-9和Caspase-3的切割活性。
离体重组M1与HSP 70的关系
重组天然M1和M1突变体(∼5 μ(G)以前固定在镍上2+在4°C的HEPES缓冲盐水(HBS)中隔夜孵育,在PBS/0.3%吐温中广泛洗涤去除未结合蛋白后,将M1蛋白与Hsp 70(10)共同孵育。μ(G)或Hsp70AAAA(10μ(G)在HBS中4°C作用4h。用HBS广泛清洗珠子以去除非特异性结合蛋白。用4×样品缓冲液分离剩余蛋白,用SDS-PAGE和免疫印迹法对Hsp 70进行分析。同样,在互惠实验中,重组Hsp 70或Hsp70AAAA或Hsp70EEVD(∼5 μ(G)预固定在Ni上。2+,其次是M1的结合和免疫印迹(10)μ(G)蛋白质。
离体重组hsp 70、m1和突变体存在下proaspase-9的活化
CYTc(10μ(G)和dATP/ATP(1mm)在Hsp 70存在或没有Hsp 70(5毫米)的情况下孵育。μg)或Hsp70AAAA(5μ(G)或HSP 70(5)μg)和M1(10μ(G)或HSP 70(5)μ(G)和M1Δ128-165(10μ(G)胞浆Jurkat细胞提取物(50)μ在37°C时,hsp 70和m1蛋白在5℃下孵育30 min,然后再加入dATP/ATP和cyt。c加法。然后,用免疫印迹法评估Procaspase-9的切割.
统计分析
数据表示为至少三个独立实验的平均±S.D。n≥3)。在所有的测试中,P0.05被认为具有统计学意义。