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摘要癌症全基因组和转录组测序(cWGTS)在肿瘤学中的效用日益得到认可。然而，由于需要在临床相关的时间范围内提供结果，以及对检测灵敏度、报告和结果优先级的关注，实施cWGTS面临挑战。在一项前瞻性研究中，我们开发了一个工作流程，在9天内报告全面的cWGTS结果。将cWGTS与诊断组分析进行比较，证明了cWGTS在单一工作流程中以相当的灵敏度捕获所有临床报告突变的潜力。基准测试确定临床WGS测... 摘要虽然使用DNA条形码对样品进行多路复用彻底改变了生物医学发现的步伐，但基于实时成像的应用的多路复用受到了荧光蛋白数量的限制，这些荧光蛋白可以使用普通显微镜设备进行解卷积。为了解决这一限制，我们开发了可视条形码，通过靶向特定亚细胞位置的不同荧光蛋白来区分单细胞的克隆身份。我们证明了这些条形码的去卷积是高度准确的，并且对许多细胞扰动是鲁棒的。然后，我们使用可视条形码，通过将不同活报告子的12... 摘要癌蛋白SS18-SSX是滑膜肉瘤的标志。然而，作为SS18-SSX融合蛋白的一部分，SS18的功能仍不清楚。这里，我们描述了人类SS18/BRG1和酵母SNF11/SNF2亚复合物的结构。这两个亚复合物组装成具有相似构象的异二聚体，表明SNF11可能是SS18在染色质重塑复合物中的同源物。重要的是，我们的研究表明，固有无序区QPGY结构域的自缔合导致SS18或SS18-SSX的液-液相分... 摘要RNA结合蛋白在分泌途径中的生物学作用尚未完全确定。在这里，我们描述了人类HDLBP/Vigilin直接与超过80%的ER定位mRNAs相互作用。PAR-CLIP分析显示，这些转录物代表高亲和力的HDLBP底物，并特异性结合于其编码序列(CDS ),与CDS/3’UTR结合的胞质mRNAs相反。HDLBP与长的富含铜的基序强烈交联，这些基序经常位于ER定位的mRNAs的CDS中，并导致高... 摘要扩散的癌细胞经常寄居在次级器官的脉管系统附近。然而，我们对血管周围部位引起的细胞串扰的理解仍然是初步的。在这里，我们确定了在乳腺癌肺部定植期间，控制促转移血管小生境形成的细胞间机制。我们发现，在转移相关内皮细胞(ECs)中诱导的特定分泌因子通过增强干细胞特性和癌细胞的生存力来促进小鼠的转移。通过tenascin C (TNC)刺激Toll样受体4 (TLR4)激活的血管周巨噬细胞，通过分... 摘要对缺氧和难治性实体肿瘤的有限治疗效果阻碍了光动力疗法的实际应用。在此，我们报告了我们对锇-过氧化物络合物(Os2)，它在黑暗中不活跃，但能释放一个过氧配体O2•−即使在没有氧气的情况下，在光照射下也会转化成细胞毒性锇络合物(Os1). Os1在低氧肿瘤中存在或不存在辐射时具有细胞毒性，表现为化疗药物。同时，光激活的Os2诱导活癌细胞内源性1，4-二氢烟酰胺腺嘌呤二核苷酸光催化氧化，导致铁... 摘要用雄激素受体途径抑制剂(ARPIs)治疗前列腺癌导致出现耐药性肿瘤，其特征是谱系可塑性和向神经内分泌谱系的分化。在这里，我们发现ARPIs诱导了由大规模染色质重塑介导的快速表观遗传改变，以支持干细胞/神经元转录程序的激活。我们发现前神经元转录因子ASCL1基序富含在超可及区域。ASCL1作为谱系可塑性神经元转录程序的驱动因子，支持治疗抗性和神经内分泌表型。靶向ASCL1将神经内分泌谱系切... 摘要染色体易位产生的致癌融合蛋白在癌症中起主要作用。其中，EWSR1和转录因子之间的融合产生具有强大染色质调节活性的癌基因，能够在许可的前体细胞中建立复杂的基因表达程序。在这里，我们定义了透明细胞肉瘤的表观遗传学和三维连接景观EWSR1-ATF1融合基因。我们发现EWSR1-ATF1表现出独特的DNA结合模式，需要EWSR1结构域并促进ATF1重定位到新的远端位点，导致染色质活化和控制原发性... 摘要最近在细胞系和有限数量的原发性肿瘤中提出了由关键转录调节因子的表达定义的小细胞肺癌(SCLC)的分子亚型。转移性小细胞肺癌中神经内分泌(ne)亚型的临床和生物学意义，以及它们在患者肿瘤内部和之间以及在患者衍生模型中的变化程度尚不清楚。我们综合了一系列转移部位的小细胞肺癌的组织学、转录组、外显子组和治疗结果，揭示了肿瘤内和肿瘤间NE分化的复杂异质性。转录组分析证实了先前描述的亚型，基于AS... 摘要AKT是PI-3K信号通路的关键分子调节因子，在不同的实体癌类型中发生体细胞突变，异常的AKT激活促进癌细胞生长、存活和代谢的改变1,2,3,4,5,6,7,8。最常见的akita television 秋田电视突变(AKT1E17K)使受影响的实体肿瘤对AKT抑制剂疗法敏感7,8。然而，我们对AKT中潜在激活突变的长尾的通路依赖性和抑制剂敏感性知之甚少，这限制了我们在预期特征的癌症患者... 免疫荧光方法中的重要环节1、冰冻切片制备：建议用新鲜组织，否则组织细胞内部结构破坏，易使抗原弥散。选用干净锋利的刀片、组织一定要冷冻适度等，防止裂片和脱片严重。2、组织切片固定：切好片风干后立即用冰丙酮等固定液进行固定5-10min，尤其要... 免疫组化成功的经验和失败的教训汇总1. 石蜡切片在染色过程中出现脱片现象？一般来说，如果用多聚赖氨酸包被过的片子做正常免疫组织化学染色的话是不会掉片子的。但如果要做抗原修复的话，如果片子处理不好的话是有可能掉片子的。你可以试试一下的方法：a... 免疫组化技术常见问题：1、石蜡切片和冰冻切片的比较？2、一抗和二抗的选择要点和技巧是什么？3、在什么情况下使用Triton-X100？4、封闭血清的选择原则是什么？5、抗体孵育条件的比较？6、一抗4度孵育后为什么要进行37度复温？7、DAB... 临床常用免疫组化指标的意义临床病理工作中，我们常用到“肿瘤细胞免疫组化耐药预后标记”，但是许多单位只写阳性结果，不写临床意义，其结果对临床帮助不大，因为许多医生不懂得这些结果的意义，因此建议大家在出此类报告时，把“肿瘤细胞免疫组化耐药预后标... 中国药典细菌内毒素检查法学习与讨论本法系利用从鲎的变形细胞中提取的试剂来检测或量化由革兰阴性菌产生的细菌内毒素，以判断供试品中细菌内毒素的含量是否符合规定的一种方法。细菌内毒素检查包括两种方法，即凝胶法和光度测定法，后者包括浊度法和显色基质... 细菌内毒素检查法研究进展细菌内毒素试验（简称“鲎试验）。自1973年以来，鲎试验被证明是一种有效检测细菌内毒素（热原）存在的试剂。于是1973年美国食品与药品管理署（FDA）就推荐鲎试验用于生产工艺流程的内毒素质量控制。因为这种鲎试验的灵敏... 免疫沉淀（IP）的常见问题及解答1. 用于一般免染的抗体是否都可以用作免疫沉淀实验？ 答：抗体的性质对免疫沉淀实验影响很大。抗体不同，和抗原以及Protein G或Protein A的结合能力也就不同。所以一般免染能结合的抗体未必能用于IP... |
